Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms