Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRJQ12913 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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PTPRJQ12913 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRJQ12913 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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