Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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