Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TROQ12816 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TROQ12816 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TROQ12816 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TROQ12816 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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