Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms