Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 QTRT2-215ENST00000493014 1046 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL135937.1-201ENST00000418690 729 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC007879.1-201ENST00000435643 554 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC017091.1-201ENST00000513551 1061 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ETFBKMT-204ENST00000538391 1067 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNB1Q02641 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms