Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC2Q02487 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms