Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRG1Q02297 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms