Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CENPEQ02224 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms