Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC6A3Q01959 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms