Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XPCQ01831 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms