Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms