Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms