Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP46P62068 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP46P62068 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP46P62068 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP46P62068 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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USP46P62068 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP46P62068 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP46P62068 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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USP46P62068 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP46P62068 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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