Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFM1P61960 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms