Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms