Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EPHB4P54760 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms