Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPAP53621 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPAP53621 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COPAP53621 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms