Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSNK1EP49674 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms