Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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