Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPA3P35244 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPA3P35244 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPA3P35244 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms