Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNB1P35222 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms