Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms