Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGER1P34995 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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