Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ECHS1P30084 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms