Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTX3P26022 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms