Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LMO1P25800 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms