Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA6P23229 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms