Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP1P21291 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms