Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF2P19878 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF2P19878 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF2P19878 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF2P19878 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF2P19878 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCF2P19878 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCF2P19878 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCF2P19878 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NCF2P19878 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms