Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM21P19474 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM21P19474 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms