Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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NELFEP18615 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NELFEP18615 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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