Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXB4P17483 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HOXB4P17483 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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