Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA4P13612 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms