Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN1P12814 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms