Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms