Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms