Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ESRRAP11474 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms