Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms