Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
C8orf88P0DMB2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms