Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TRAPPC2P0DI81 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TRAPPC2P0DI81 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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