Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYNP07948 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYNP07948 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYNP07948 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms