Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSNP06396 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GSNP06396 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GSNP06396 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms