Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA4FO95754 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms