Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRATO95237 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRATO95237 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRATO95237 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms