Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK1O94907 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK1O94907 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK1O94907 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK1O94907 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms