Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms