Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SEC22BO75396 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC22BO75396 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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