Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSL4O60488 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms