Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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HOXA3O43365 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HOXA3O43365 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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